s3cmdではデフォルトでUSリージョンが設定されます。

これを東京リージョンで設定するには、ホームディレクトリの.s3cfgを編集します

以下の4つのオプションをそれぞれ書き換えれば大丈夫です

bucket_location = ap-northeast-1
host_base = s3-ap-northeast-1.amazonaws.com
host_bucket = %(bucket)s.s3-ap-northeast-1.amazonaws.com
simpledb_host = sdb.ap-northeast-1.amazonaws.com

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